随着水稻田除草剂的推广应用，极大地减轻了农民劳动强度，但除草剂使用不当，也会给水稻生产造成严重后果。
1、不能滥用。一般选用丁草胺或扑草净这两种药剂。
2、不能超量。有些农民认为要想田中草没有，就得加大用量，这样造成秧苗长时间不扎根，发黄，甚至大片死苗。实际上药包上的使用说明上的量是经过多年大面积示范应用过的合理用量，使用时切不可随意加大用药量。
3、不能过早用药。秧苗栽插三天以后才开始恢复生机，扎根生长，如栽后就施药，严重影响秧苗扎根返青，极易造成死苗，僵苗。因此栽插后3至5天开始用药。
4、施药后不能深水。稻田施用除草剂后既不能缺水，也不能深水，以免影响药效和发生药害，施药时田间保持3至5厘米的水层，保水5至7天。
5、及时补救。施用除草剂5天后，如发现秧苗发黄，发红，新叶不生长，拔出秧苗观察未扎新根，即发生了药害，应及时排出田水，重新灌水，并喷施生根解毒营养剂抓紧补救，促使及时恢复生机。