灰霉病在冬春季节保护地内低温、高湿，内外气候条件变化较大，发病较严重。主要发生在花期和结果期，地上部位均可发病。幼苗发病，叶片和叶柄上产生水渍状腐烂，之后干枯，表面产生灰霉，严重时可扩展到幼茎，使幼茎产生灰黑色病斑，腐烂折断。成株期叶片发病，叶尖开始时出现水渍状浅褐色病斑，病斑呈“V”字形，并逐渐向内发展，潮湿时病部长出灰霉，边缘不规则，干燥时病斑呈灰白色。
及时摘除病叶、病果，放入塑料袋内拿出棚外集中烧毁或深埋，在番茄坐果后及早摘除残留的花瓣。浇水应在晴天上午进行，浇水后马上关闭通风口，使棚温升到33℃，保持1小时，然后迅速放风排湿3-4小时后。控制棚室内的温、湿度。在番茄苗定植移栽前喷一次药，以确保无病苗进入棚室。喷用护树大将军消毒杀菌。定植后结合蘸花施药，在蘸花稀释液里，加入杀菌剂后再进行蘸花。发病初期，可用针对性的药剂+新高脂膜喷雾防治。