玉米秸秆除喂牛羊外，也可用来制作无公害农家肥。玉米秸秆利用得当，要比化肥好得多，为保证玉米秸秆肥的质量，在堆制过程中应注意下面五点：
一、搞好玉米秸秆处理。先把玉米秸秆切成3~4厘米长，也可用粉碎机进行粉碎，用粪尿浸泡，以浸透为宜。
二、原料配比要适当。堆制玉米秸秆肥，提高肥效原料配比很关键。切碎的玉米秸秆、土、牲畜粪、人粪尿，配制比例为6∶1∶2∶1，混拌均匀后进行堆制发酵。秸秆和水的比例以1∶3为宜。
三、严格控制堆内温度。发酵期间温度应控制在50℃~60℃，这对微生物分解纤维细菌活动最为有利。
四、堆制后10天左右翻倒二次，以后每隔7天倒一次，共倒3~4次。