红南瓜病毒病又称花叶病，其症状表现为：红南瓜植株生长发育迟缓，植株顶端叶片产生深浅相间的花叶病斑，叶片变小萎缩，甚至皱缩、畸形，严重时伴有蕨叶、小叶和鸡爪叶。叶脉产生淡褐色的坏死，叶柄和瓜蔓上则产生铁锈色坏死斑驳，常使叶片焦枯，蔓扭曲，蔓节间缩短，植株矮化。果实受害变小，畸形，引起田间植株早衰死亡甚至绝收。
防治病毒病应以预防为主，搞好综合防治。做好种子消毒，使用新高脂膜进行浸种，浸种后捞出晾干即可下种。可保温、保湿、吸胀，提高种子发芽率，使幼苗健壮。驱避地下虫害，隔离病毒感染。也可与种衣剂混用。在红南瓜生长阶段，适当增施磷钾肥，及时浇水，预防干旱，结瓜后，叶面均匀喷施壮瓜蒂灵，提升植物吸水吸肥力度，提升果实产量和质量，降低落瓜率，减少裂瓜、僵瓜、畸形瓜发生率，防治病毒病的滋生，并带肥浇水。防治蚜虫,用新高脂膜配合针对性杀虫剂喷雾，每隔15天喷施1次。