病害方面：主要是白粉病、条锈病、叶锈病、纹枯病、叶枯病、赤霉病、全蚀病和黑穗病等。
虫害方面：主要是蚜虫、吸浆虫、麦蜘蛛、蛴螬、金针虫、蝼蛄、黏虫、麦叶蜂和麦秆蝇等。
上述各种病虫害有时是单独发生，但在生产上多是两种以上病虫害混合发生，若不切实加强防治，就会造成重大生产损失。
高产小麦病虫为害更严重的原因是多方面的：一事小麦高产良种对病虫害的综合抗性较差。在选育高产小麦新品种时，多偏重是否具有较大的高产潜力，以及对主要病虫害的抗性，而对其它病虫害，只要是易于防治的，往往不求全责备，故其综合抗性较差，致使病虫害发生较重。二是小麦高产田中前茬作物遗留的秸秆味精充分腐熟而且不能掩入土壤的深层。不少地方只提倡秸秆还田，不注意深埋掩盖灭菌。味精高温堆沤或牲畜过腹还田的秸秆，携带有较多的病原菌，易造成病菌传播。三是小麦病害的一些生理小种发生新的变化，对某些病害本来具有一定的抗性，但因这些病害生理小种的变化，致使原有高产良种丧失抗性，造成该病流行。四是现阶段的小麦中产变高产或大面积高产再高产，大多是依靠增加穗数为主的手段夺取高产，这就必然要增加群体数量和加大肥水供应。在肥水充足和群体较大的条件下，高产麦田小气候恶化，表现在株间光照不足，湿度较大，通风不良，温度增高，利于病虫害的滋生蔓延。以纹枯并为例，以往并不威胁小麦生产，但在高产麦田成了严重的病害。这是小麦高产田病虫害更重的主要原因。