隔沟交替灌溉简便易行，是既节省水又提高水分利用率和转化效率的好方法。隔沟交替灌溉就是沿树冠外树行两侧各挖1条深约15～20厘米，宽约20～30厘米的排灌沟，灌水时沿果树一侧的沟灌足水，在下一次灌水时只灌上次没有灌过的另一侧沟，实行交替灌溉，使两次灌水之间对苹果根系实行干湿交替，使整个果园且顺序间隔一条灌水沟供水的灌溉措施。
隔沟交替灌溉苹果根系，一半区域保持干燥，而另一半区域灌水湿润，在灌水时结合根施通施入，可增强根系分蘖质量，促进须根茂密，生根、壮根，提升根系导管输送养分能力和新陈代谢频率。干湿交替，使光合产物在不同器官之间得以最优分配，提高了果实品质。