不少人认为，在同一个棚内空间内，种植一高一矮的两种作物，能充分利用空间，提高种植效益。但是，对于黄瓜和番茄来说，就不宜同棚种植，主要会有以下几种弊端：
一、加重蚜虫危害。黄瓜和番茄都易受到蚜虫的危害，一方发生蚜虫，另一方也很快被传染，很难有效进行防治。
二、两者相互抑制。作物在生长发育过程中，都会释放出一定的分泌物和气味，而黄瓜与番茄的分泌物和气味有互相抑制对方生长发育的作用。如果将这两种作物进行邻作栽培，其生长势和栽培效益都会受到影响，二者作物都长不好。
三、不易管理。黄瓜与番茄在生长发育过程中所需的温度条件不同，因此将二者邻作栽培，在温度管理上根本无法做到二者兼顾，往往是顾此失彼，从而大大降低了二者的栽培效益。