1、基肥。圆葱基肥一般亩施有机肥1000千克左右、过磷酸钙30千克、硫酸钾15千克，将上述各种肥料混匀后，结合翻耕、整地把肥料施入土中的中上层，然后移苗栽植。
2、追肥。圆葱一般追肥三四次。第一次在定植后1星期内，亩施20%的人粪尿800千克，或硫酸铵10千克，加水800千克浇施。第二次在开春后，亩施30%的人粪尿800千克，或硫酸铵10千克，加水800千克，结合中耕培土浇施。第三次在葱头开始膨大时，亩施50%的人粪尿800千克，或硫酸铵10千克、硫酸钾5千克，加水800千克，结合中耕除草浇施。
3、补施磷肥。磷对圆葱幼苗期的发育十分重要，直接影响圆葱株高和叶数的增加。圆葱一旦出现缺磷症状后再向土壤追施磷肥不会及时满足圆葱的需求，必须在基肥中配加磷肥来预防，但可以采用叶面喷施磷酸二氢钾的方法作为应急措施。补施磷肥时要特别注意量的控制，如果磷素吸收过剩，则会引起鳞茎外部的鳞片缺钙，内部鳞片缺钾，鳞茎盘(底盘)缺镁，肌腐、心腐和根腐等生理病害发生严重。