玉米锈病的发生是由外来病菌引起的，田间植株感病后夏孢子主要借气流传播,进行再侵染。6月底见夏孢子,8月中旬达高峰。6月中旬至7月中旬为玉米锈病的侵染期。玉米锈病从7月中旬开始发病，8月底发病盛期,抽雄吐丝期达到高峰。由于锈病发病最适温度为26-35℃，在连阴雨或潮湿条件下，发病速度加快。而近期多阴雨,湿度较大，因此，广大农民朋友要注意防治玉米锈病。
1、选择抗病、高产、优质马齿型中早熟品种。不同玉米品种对锈病的抗性有明显差异，通常早熟品种易发病，马齿型品种较抗病。筛选抗源，加强玉米的抗锈育种，是预防玉米锈病的有效措施。
2、加强田间管理。调整播期，使玉米主要发病期避开病菌感染期，以减轻为害；偏施氮肥，磷肥、钾肥和微肥的用量少，植株营养生长过旺，抗逆性就差，对玉米锈病的发生有利，生产上应多施腐熟的农家肥，增施磷、钾肥和微肥，避免偏施氮肥；中后期叶面喷施微肥,达到壮苗抗病目的；中耕松土,供、排水适量,创造有利于玉米健壮生长发育的条件,提高玉米植株的抗病性；清洁田间环境，及时清除田间病株残体,并集中烧毁或深埋,以减少侵染菌源。
3、化学防治。使用化学药剂防治的作用是抑制孢子萌发和防治病害,掌握预防为主,综合防治的原则。生长前期(大喇叭口期至抽雄期)喷施12.5%禾果利WP375g/hm2对水225～375kg，每隔10d喷1次,连喷2次,可预防锈病的发生；发病初期，喷12.5%速保利WP180g/hm2对水600～750kg,或65%代森锌500倍液、20%三唑酮EC800倍液喷雾,每隔7d喷1次,连喷2～3次。为了延缓抗药性的产生，建议结合其他措施进行联合防治。如利用轻感品种加种衣剂处理，或与其他病害协同防治，以达到经济有效地防治玉米锈病。
4、轮作倒茬。连作能使病原菌在土壤中积累，特别是玉米秸秆不经处理直接还田，使土壤带菌量增大。与非禾本科作物轮作，可减少病原菌积累，不但可减轻锈病的为害，也可减轻其他玉米病害的为害。