马铃薯环腐病是一种常见病，该病菌属细菌，在土壤中存活期短，主要在薯块中越冬，传播途径为带病种薯，因此须重视防治。
1、种薯严格管理（1）调运时要加强检疫，严禁从病区调种。（2）块茎收获后，先放在通风场所摊放2～3星期，气温稳定在0℃时入窖，入窖前对种薯严格复选，剔除病烂薯、机械损伤、虫伤、受淹、受冷害的薯块。（3）贮藏时要选择避风向阳排水良好的地方。贮藏期间保证通风透气，温度保持在1～3℃，相对湿度90%左右，经常检查，发现病薯连同周围薯块及时剔除。
2、小整薯播种小整薯生命力强，抗病性好，同时可避免环腐病菌等交叉感染，也避免切面愈合不好，腐生菌的入侵。生产上提倡优先选用小整薯作种薯。
3、整薯催芽，催芽前严格剔除病薯；切前尽可能多准备切刀，切刀先进行酒精或火焰消毒；或切刀放入50毫/升的硫酸铜溶液中浸泡10分钟以上。
4、配方施肥，垄作栽培增施有机肥，氮、磷、钾约以2.5∶7∶4.5配比为宜。