1.种子消毒：播种前建议对种子进行消毒处理。即10%磷酸三钠浸种15～20分钟，然后用清水冲洗干净以杀灭种子表面的病毒，晾干后播种。
2.育苗灌根用药可用强内吸剂25%阿克泰可分散粒剂一次性喷雾防治，持效期可长达25～30天。方法是在移栽前2～3天，用阿克泰1500～2500倍液（一喷雾器水加6～8克药）喷淋幼苗，使药液除喷叶片以外还要渗透到土壤中。平均每平方米苗床喷药液2公斤左右。
3.可选用25%阿克泰水分散粒剂2500～4000倍液或10%吡虫啉可湿性粉剂1000倍液或2.5%绿色功夫水剂1500倍液喷雾灭蚜。对没有设置防虫网的大棚，已经感染病毒病的番茄植株，可以考虑用6～8克的阿克泰对一桶水进行一次彻底封杀棚内蚜虫和飞虱。也可选用20%病毒A可湿性粉剂500倍液或1.5%植病灵乳油1000倍液等喷施，有一定的抑制病毒复制的作用。
4.选用3.4%碧护晶体4000～5000倍液对病毒病症状较轻的植株进行喷施，7～10天1次。对症状较重的植株建议用4000倍液的碧护再加上芸苔素800倍液混合喷施，配合大肥水的使用，强行刺激受抑制生长矮化的番茄植株。