针对全自动自清洗形式的过滤器在冬季运行时，需要考虑防冻措施。常规的办法是过滤器缠绕包裹保温棉，对室外安装的过滤器防冻措施更要特别处理，在易冻的主要部位如：有电磁控制的排污阀，压差比较的高低压管和带有排污腔室形式的过滤器，由于此类部分水体很难流动，排水装置也不好设置，所以是保温防冻的主要部位，在缠绕保温棉的措施前有必要加装60度左右的低温伴热带,并且与过滤器同步运行。
这类过滤器防冻主要控制排污阀，压差开关的控制管线的防冻。还有一个办法，过滤器停机前人工把水全部排空。看现场用的是井水，只要停机前不冻，运行后问题不是很大，但也需要最基本防冻，用上保温棉。