夏末秋初，天气高温，光照强烈给育苗带来一定难度，但是科学管理就能保证辣椒苗子生长旺盛健壮。
1种子处理
选择好品种后，先将种子晾晒4小时，然后由磷酸三钠溶液消毒，再用清水浸泡8小时左右。捞出后稍晾，准备催芽。
2常温催芽
一般30℃左右的室温，是催芽的合适温度。把浸泡好的种子用棉布包好，再包一层塑料膜保温。每隔半天将种子用清水冲洗一下，然后再包好催芽，大约60~70小时即可出芽。芽长约3毫米时(此时称种子露白)播种最好；如果不能及时播种，应将种子放在8℃左右的条件下保存，尽快创造播种条件。
3穴盘的准备
选用专用的育苗介质，每袋可装12穴盘，每盘可育苗72棵，菜农朋友可根据自己的需要，计算出所需要的育苗穴盘和育苗介质的数量。把育苗介质混入适量的磷钾复合肥、专用生物微肥和其他微量元素等加水搅拌均匀后，装穴盘整平后(用笔直的木板刮平即可)播种。
4预防高温
播种后将穴盘浇透水并结合喷施普力克，然后覆盖地膜保湿。此时应注意遮荫降温，严防蒸坏种子而影响出苗。此时白天温度应掌握在30℃以下，夜间温度在18℃以下，待出苗80%左右时就可揭掉地膜。随着幼苗的生长即可缩短覆盖遮阳网的时间，这样更利于幼苗生长。
5预防干旱
播种出苗后，注意苗床湿度，不要过湿或过干。如穴盘过分干旱，易形成弱苗，容易感病。所以要适当浇水，浇水时间应在晴天的早晨。
6预防苗子徒长
夏季辣椒育苗徒长主要原因是因为夜温高，呼吸作用强，消耗养分过多，或是氮肥和水分充足造成了苗子徒长。另外，苗子过密互相遮挡阳光，影响了光合作用。因此预防苗子徒长应注意首先防止夜温过高，穴盘内湿度过大；再就是在浇冲施肥时少施氮肥；第三就是等苗子长到一定大小时，将穴盘间距拉大，增加通风透光度，增强光合作用避免苗子徒长。
7预防暴雨危害
将苗床设在棚内的，一般选用1膜2网覆盖方式(塑料膜加遮阳网和防虫网)，待有大雨时，可将棚膜拉下并埋好，预防雨水对苗子的淋冲及雨水传播病菌。
8预防病虫害
可在育苗棚设严密的防虫网；利用害虫的趋性设置黄板诱蚜、白粉虱，用蓝色板诱杀蓟马等；必要时要选用药剂防治，此时应加强预防的病害就是苗期猝倒病、立枯病和生长中期的病毒病，除了做好种子消毒外，还要进行苗床消毒，可在播种后喷灌多菌灵或苗菌敌混入丰收一号，既能有效抑制土传苗期病害，又可促进苗期根系的发育，苗齐苗壮。