渠系水量调配不仅要考虑灌区水源来水和渠首引水方式，还要考虑灌区农作物需水变化情况。灌区渠系输配水调配方法主要采用续灌和轮灌两种方式。
1、续灌。当水源比较丰富，供需水量基本平衡时，渠首向全灌区的干支渠道采用同时连续供水的方式，即续灌配水。续灌时，水流分散，同时工作的渠道多，长度长，渠道渗漏损失量大。其优点是全灌区的各用水单位基本上可同时引取水量，不致因供水不及时而引起作物受旱减产，全灌区受益比较均衡，这是想干支渠道输水的正常方式。但当水源来水量大幅度减少时，就不宜采用，否则水流分散后的干支渠道流量锐减，水位降低，不仅使渗漏损失增大，而且使斗、农渠取水困难。因此，一般当渠首引水流量降低到正常流量的30%~40%时，就不宜采用续灌，而采用干支渠轮灌的取水方式。
2、轮灌。当渠首引水流量锐减时，一般在干渠之间或干渠上、下游段之间实行轮灌配水，把有限的引水量集中供给某一条干渠，灌完以后，再供给另一条干渠；或先供给干渠下游段，后供给干渠上游段。采用轮灌配水方式，水流比较集中，同时共组偶的渠道长度较短，渠道渗漏损失小，输水的速率也随着渠道流速的提高而提高。但其缺点是造成一些用水单位可能灌溉不及时，产生受益不均匀。因此，干渠之间或干渠上下游段之间实行轮灌，是一种非正常情况下的输配水方式，只有当渠首引水流量降低到一定限度时才采用。而在支斗渠道内部实行轮灌则是正常的配水方式，即将支渠引取的流量，按预先划分好的轮灌组，按组配给各条斗渠，斗渠的流量又按组配给各条农渠。