1、强调使用生物和生化制剂。如农用链霉素、春雷霉素、多氧霉素、科生霉索等微生物农药。植物源农药，如茶籽饼、烟茎、除虫菊、苦皮藤、草木灰、辣椒水等生化制剂。
2、强调选用高效、低毒、低残留的化学农药。如灭菌脂、克螨特、波尔多尔等。
3、强调对症下药：防治各种霉菌采用扑海因(又名异菌脲)、桑迪恩、普克特(又名霜毒菌)、百维灵、甲霜灵锰锌(为甲霜灵、代森锰锌配制)、百菌清。防治菇蚊、菇蝇、蝼蛄及蛆虫等，采用锐劲特(又名氟虫晴)、辛硫磷、阿维菌素(又名爱福丁、齐螨素)、乐斯本(又名氯吡硫磷、毒死蝉)。
4、强调安全浓度与剂量：同时做到科学用药，栽前棚地室内消毒，土壤处理采取面上喷施；菌袋及虫害发生时，采取局部施药，时间一般应于上午，夏天宜于下午或喷水前用药。
5、强调禁用剧毒和高残留农药。特别强调菇品采收期，禁用一切农药。