选择优良品种的脱毒种薯是栽培无公害马铃薯的根本措施。适于黑龙江栽培的早熟品种有东农303、出苗到成熟45-60天；北薯1号，出苗到成熟65-80天。中晚熟品种有克新2克、3克、4克，生育期在105-120天。选择品种一定要依据当地的自然条件、土壤条件、栽培方式等因素综合来决定。
无公害马铃薯的种薯可采取催芽来处理。选用幼龄薯和壮龄薯做种薯。
