碳酸氢铵不宜在温室、大棚内施用，因为碳酸氢铵在温室内容易分解为氨气而挥发，浓度过大还会重伤作物的叶片，而且碳酸氢铵不宜浅施，碳酸氢铵的施用深度应在6厘米左右，并且在施用后要立即履土。
硫酸铵不宜长期连用，因为硫酸铵属于生理酸性肥料，如果在同一地块里长期施用，会增加土壤酸性，破坏土壤结构，在碱性土壤中，硫酸铵中的铵离子被吸收，而硫酸根离子残留在土壤中与钙发生作用，容易使土壤板结变硬。
腐熟的有机肥不宜与碱性肥料混合施用，如果与碱性肥料混合，会造成氨的挥发，降低有机肥的养分含量。
硝态氮肥不宜与有机肥混合施用，因为有机肥含有较多的有机物质，遇硝态氮肥在反硝化细菌的作用下发生反硝化作用，使氮素损失。