大蒜病虫害日渐呈一种上升趋势，尤其是近些年蔬菜面积不断扩大，单一种植日益增多，保护地发展迅猛，农药的滥用。所有这些都是造成今天病虫种类增多，危害蔬菜日渐加重，代数重叠危害的时间加长，病虫的抗药性增强。近年来，随着大蒜种植面积的扩大，耕作制度及栽培生态环境不断变化，大蒜植株的抗病性也逐年降低，大蒜病害造成的损失越来越大。尤其是新病害的不断出现，某些病害甚至呈急剧上升趋势，更加剧了对大蒜的危害。大蒜病害对大蒜的危害一般损失率达20％～30％，严重年份及地块可以达到50％以上，甚至大蒜更高。目前，危害我县大蒜病虫害主要有蓟马、叶枯病及锈病、紫色病等。
1、大蒜蓟马：危害大蒜时以成虫和若虫挫吸大蒜的叶、嫩茎的表皮，吸取汁液，影响大蒜的光合作用。防治的药剂有10%吡虫啉可湿性粉剂，阿维菌素、0.36%苦参碱水剂、灭蚜松等药剂叶面喷雾防治。
2、大蒜叶枯病：大蒜叶枯病是蒜区大蒜上最严重的病害之一，一般年份损失10％以上，严重时可达60％左右。该病主要为害叶片和蒜薹，严重时病叶干枯，蒜薹不能抽出，或抽出时从病部折断，颜色黄白。该病主要危害叶片、叶鞘。叶片染病分二种类型，一是尖枯型。主要发生在初侵染阶段，叶尖呈深褐色，并在其上形成许多深紫褐色斜状平行的斑纹。严重的病斑扩展到全叶的1/3—4/5或全叶干枯死亡；二是叶斑型，发病初期在叶片上出现短条状小型的浸蚀斑，略凹陷，后病斑迅速扩大，变为梭形至长椭圆形，组织坏死，凹陷，多为紫褐色，中央色较深；叶有的呈乳白色。大流行时经10—15天全田枯死。防治叶枯病可与发病初期喷洒50%速克灵可湿性粉剂1000倍液，50%苯菌灵或湿性粉剂1500倍液，50%多霉灵（多菌灵．万霉灵）可湿性粉剂1000倍液，隔7—10天再喷一次，连续防治2—3次。
3、大蒜锈病：大蒜锈病每年均有发生。常年发病株率为10％以上，发生重的年份可达80％以上。该病主要为害叶片，其次为害假茎；病株蒜头明显变小，易开裂散瓣，商品价值明显降低。防治大蒜锈病，一般选用15％粉锈宁可湿性粉剂1000倍液，或15％粉锈宁可湿性粉剂1500倍液加70％代森锰锌可湿性粉剂1000倍液兑水喷雾防治，一般视病情防治2～3次。
4、大紫蒜斑病：大紫蒜斑病主要危害叶片和花梗，受害部位初呈水渍状白色小点，略凹陷，以后逐渐成黄褐色至灰褐色霉层，严重时导致叶片变黄枯死或折断。防治药剂有扑海英、58%甲霜灵锰锌，7-10天喷一次，2-3次。