水稻出苗后,为培育壮秧,防止出现高温催苗和立枯病等病害发生，秧苗管理十分关键。
一是如果育苗时苗床覆盖地膜的，要在出苗后及时撤掉地膜，防止高温烧苗。
二是苗床温度管理：水稻的生长过程中一般高温长叶，低温长根。因此在温度管理上应坚持促根生长的措施，严格控制温度。据观察育苗期间，晴天外界气温与棚内温度是加倍关系，如气温15℃时棚内温度就可能达到30℃，所以可以利用这个规律，出苗后，当天的气温15℃以上时，就应早点留小通风口，随温度的升高逐步扩大通风口。出苗前棚内温度超过30℃时就应留通风口，出苗～2.5叶前，棚内温度控制在30℃以下，秧苗2.5叶后，棚内温度控制在25℃以下。
三是水分管理：育苗过程中水分管理是最重要的技术，水稻育苗最不好的习惯是一次性浇水少，浇水次数多。这样的浇水方法不仅不利于提高苗床温度，而且因为表层水分多还影响水稻根的发育使秧苗容易徒长，所以育苗期间尽可能少浇水。浇水标准是早晨太阳出来前，如果稻叶尖上有大的水珠（这个水珠不是露水珠，而是水稻自身生理作用吐出来的）时，不应浇水，没有这个水珠就应当早上浇一次透水。因抛秧盘育苗的根系不能扎到土中，浇水时不能完全按着这样的标准浇水，应根据实际情况灵活掌握。就是把握需浇水时一次浇透，不要勤浇水的原则,如需浇水时应在上午10点前浇。
四是苗期立枯病等病害防治：苗床土壤酸度PH值7以下，并且出苗后及时通风炼苗，控制苗床温度和湿度是防止立枯病等发生的关键。一旦发生时可喷施甲霜灵等药剂防治。