1.平菇褐腐病：又称褐斑病，其症状是发病后菇体变黄、腐烂并有臭味，发病原因是病原菌或潜伏于土壤内，或进入基料，也可随气流等进入菇棚，尤其菌丝因营养供给不足、抗性下降、加之高湿及通风不良等。
2.平菇腐烂病：细菌性病害，高湿条件下通风严重不良。
3.草菇小菌核病：该病菌中长期存活于土壤及有机物中，并可对多种作物及林果等形成侵染，尤在高温高湿、通风不良时发病严重。
4.香菇烂筒病：发病原因是木霉或者青霉侵染，导致“臭袋”发生。
5.木耳流耳病：高温高湿引发的细菌性病害。
6.鸡腿菇腐烂病：温度由低到高的转换阶段，没有及时调整通风所致。