番茄在生长各时期的需肥要求都很高，对营养的吸收量较大，并随着植株生长发育和开花结果的增加而增加，养分的吸收盛期是在结果的盛期。第一果穗坐果以后，结合浇水要追施一次催果肥。每亩可施尿素15-20公斤，过磷酸钙20-25公斤，或磷酸二铵20-30公斤。缺钾时应施硫酸钾10公斤。也可用1000公斤腐熟人粪尿和100公斤草木灰代替化肥施用。以后在第二穗果和第三穗果开始迅速膨大时各追肥一次。高架栽培第四穗果开始迅速膨大时也要追肥。追肥可以土埋深施，也可以随水浇灌。前者要注意深施、封严，后者要注意施肥量，以防烧苗。
番茄栽培除土壤追肥外，还要进行叶面追肥。根外追肥可选用0.2%-0.4%的磷酸二氢钾，或0.2%-0.3%的尿素，或2%的过磷酸钙水溶液对面喷施。果实迅速膨大期如肥水不足，果实发育不整齐，果个变小，产量明显降低。