近年来，黄瓜枯萎病发生严重，田间发病率在１０％～３０％。大棚黄瓜受害更严重，常造成全株枯死，产量大减。生产上应采取综合措施防治。
黄瓜苗期到结果期均会发生枯萎病，开花结果期发病最重。被害植株叶片中午萎蔫下垂，早晚恢复，严重时整株枯死；主蔓基部稍收缩、纵裂，湿度大时病部表面出现白色或粉红色霉状物，根部腐烂，易拔起。田间积水、土壤潮湿、久雨后遇干旱或时雨时晴、连作或土质黏重的田块易发病，秧苗老化、施肥不足、偏施氮肥发病重。
农业防治根据各地情况选用中农５号、中农７号、中农８号、山农１号、早丰２号、早青２号、津春３号、露地３号等抗枯萎病品种。播前用６０℃水浸泡种子１０分钟，并用种子重量０．１％的５０％多菌灵可湿性粉剂拌种。选择地势高爽、排水良好的沙质壤土地种植，与非瓜类蔬菜实行３年以上轮作。播种时每亩用５０％多菌灵可湿性粉剂或７０％甲基托布津可湿性粉剂或９５％敌克松可溶性粉剂１．２５公斤，与细土按１∶１００的比例配成药土后撒施于床面。移栽前用等量的７０％甲基托布津和５０％福美双与５０倍细土配成药土后，施入定植穴或定植沟内，防效比灌根好。发现病株及时拔除，带出田外深埋，同时在病穴及四周灌２０％石灰乳或４０％代森铵水剂４００倍液消毒土壤，以减少菌源。轻微发病田，夏季可高温闷棚，消灭枯萎病菌。每亩撒施石灰５０～１００公斤、碎稻草５００公斤，翻入６０厘米深的土中后做高３０～３５厘米的垄，垄沟内灌满水，覆盖地膜后闷棚１０天。闷棚期间垄沟内保持满沟水。
药剂防治发病初期，将蒜头捣烂后加２０倍水浸泡半小时，取滤液喷洒；或者选用１０％多抗霉素可湿性粉剂１０００倍液、瑞锌合剂１４００倍液、５０％多菌灵可湿性粉剂５００倍液等喷施，每隔７～８天喷一次，共喷３次。早晨露水未干时，撒施石灰和草木灰混合粉，并选用４０％抗枯灵、７０％甲基托布津可湿性粉剂、４５％代森铵水剂１０００倍液，９５％敌克松可溶性粉剂７５０倍液，１０％双效灵水剂３００倍液等灌根，每株灌２５０～５００毫升，每隔７～１０天灌一次，共灌２～３次。开花坐果期，每亩用９０％晶体敌百虫５００克加５０％托布津可湿性粉剂或５０％多菌灵可湿性粉剂５００克，加水６０公斤灌根，每株灌２００毫升，每隔７～１０天灌一次，连灌２次，以控制病情发展。