大棚、温室早熟番茄生产中第一、第二棚果最易出现畸形。因此，在生产中应提早防止发生。
据研究，畸形果的发生除开花期使用坐果灵等激素浓度过大外，其主要原因是幼苗期温度过低造成的，苗床要光照充足并适时适量通风，幼苗出土后要控制好温度，保持白天20℃～25℃、夜间13℃～17℃。保持苗床土壤湿润、水分适宜，以利花芽分化，育出节间短，60天左右的适龄壮苗。因植株上的第1～3穗果的第1果易形成畸形果，应在蘸花前疏去。发生畸形果后要及时摘除，以利正常花、果的发育。另外，施肥要做到氮、磷、钾、微量元素配合使用。采用配方施肥，避免偏施、过施氮肥，适量增施磷、钾肥，使花芽分化及花器得到正常生长发育所需营养物质，防止分化出多心皮及形成带状扁形花而发育成畸形果。可喷施应天2号多功能生物制剂600倍液，10～15天一次，连用2次；同时根据植株长势、长相、天气等情况和番茄的需水量合理浇水，切忌土壤忽干忽湿。