在芝麻生长的季节是降雨量比较多的季节。在多雨的季节，如果芝麻田里没有施用除草剂，常常杂草丛生，青枯病、茎点枯病、枯萎病和疫病等芝麻病害也会相继发生。草害与病害极易导致芝麻大幅度减产，要及时做好预防工作。
对于芝麻的田间杂草，可选用多种除草剂喷施，一可在播种前5-7天，每亩用48%氟乐灵乳油100-150毫升，兑水50公斤施于土表，随即耙土翻埋，混土后才能播种；二可用48%拉索乳油，每亩150-200毫升兑水75-100公斤于芝麻播种之后出苗之间喷于土表层；三可用50%乙草胺乳油70-80毫升兑水75-80公斤喷施；四可用10.8%盖草能乳油25-30毫升兑水15-20公斤于芝麻出苗之后杂草3-4片叶时喷施，均能取得较好的预防效果。
对于芝麻病害的防治，一是在芝麻出苗后用1∶1∶100倍波尔多液或0.1的硫酸铜液喷施；二是在芝麻发病初期用70%代森锰锌可湿性粉剂800倍液；三是用58%甲霜灵·锰锌可湿性粉剂500-600倍液；四是用40%多菌灵或70%甲基托布津可湿性粉剂500-800倍液；五是用40%乙磷铝可湿性粉剂300倍液等药剂，喷施1-2次。各地可结合当地的实际情况灵活选用。