1、番茄地上部和根系有着相互促进的关系，过早整枝会影响根系生长。因此打杈不可过早，第一花穗下部的腋芽应在腋芽长至3厘米长时进行。
2、采用单干连续整枝时，首先要保证肥水充足，必须注意上部侧枝的选留和培养，防止造成下部的都打去了，而上部的最终培养不出。
3、打杈时，要求不留桩，不能带掉主轴上过多的皮，要尽可能减少伤口面，一般不用剪刀等工具，因剪刀容易传染病毒。
4、整枝、打杈应在晴天上午10时至下午3时进行，这时温度高，伤口易愈合。
5、采用连续摘心整枝时，应及早进行，这样伤口小，易愈合。
6、日光温室越冬茬、冬春茬栽培常采用普通单干整枝，即早熟品种高度密植(7000至8000株/亩)，每株留一穗果；中晚熟品种每亩栽2500株左右，每株留4至6穗果，每穗结果2至3个。
7、日光温室秋冬茬、大棚春茬栽培中，常采用连续单干整枝和连续摘心整枝法。在运用这两种整枝法时，一定要重视疏花疏果。一般单株留果5至10穗，每穗留2至3个果。
8、在整枝时，对有病毒症状的植株应单独进行，避免人为传播疾病。