芹菜菌核病可危害芹菜的叶片、叶柄和茎。叶片首先发病，呈暗色污斑，潮湿时表面密生白色霉层。然后向下蔓延引起叶柄和茎发病。受害部位呈褐色水渍状，湿度大时形成软腐，表面长出白色菌丝，最后茎组织腐烂呈纤维状，茎内中空，形成鼠粪状黑色菌核。
农业防治。实行3年以上轮作。播前进行种子消毒。及时排水，降低田间湿度。及时把病叶清除出田间，集中深埋，喷施护树大将军消毒杀菌，严防病菌扩散。
药剂防治。发病初期喷洒70%甲基托布津可湿性粉剂600倍液+新高脂膜+植物细胞免疫因子提升植物抗逆性，可使病毒DNA断裂凋亡，强大免疫功能，诱生干扰素和活性细胞介素，抑制残余病毒复制，促进植物生长。5-7天喷施一次，连续防治2-3次。