早稻直播播种后遇上低于12℃气温，秧苗根系活力减退，吸水吸肥能力下降，引起根系生长缓慢，秧苗抗性下降，绵腐病病菌侵染秧苗，造成烂秧，秧苗幼芽长至1.5厘米长时是绵腐病最容易发生时间，发病时秧苗幼芽部位出现乳白色胶状物，以后长出白色绵絮状物，并向四周扩散，直到布满整粒种子。主要防治方法：
1、加强水的管理，直播田播种后至出芽前，厢面保持湿润，厢面不能过早上水；遇到低温阴雨天可短时灌水护芽，一叶一心可适当灌浅水，二叶至三叶以保温防寒为主，做到浅水勤灌；寒流来袭，做到深水护秧
低温过后逐层排水转入正常管水，管好水的关键，就是要做好大田“三沟”清理工作。
2、药剂防治，发现绵腐病时，每亩用25%甲霜灵可湿性粉剂800~1000倍液或65％敌克松可湿性粉剂700倍液或700倍液硫酸铜均匀喷施，发生严重丘块，应在换水2~3次后施药，每亩撒施草木灰15~25公斤。