1、基料配方
配方一：棉籽壳225千克，麦麸15千克，玉米粉10千克，过磷酸钙5千克，石灰粉2千克，石膏粉5千克，尿素1千克，蔗糖3千克，食用菌三维营养精素（拌料型）120克。
配方二：木屑220千克，麦麸30千克，过磷酸钙5千克，石灰粉5千克，石膏粉3千克，尿素1千克，蔗糖2千克，食用菌三维营养精素（拌料型）120克。
气温高于22℃时，可将蔗糖减掉，并加入赛百09药物，以提高发菌成功率。
2、装袋
配制好的培养料，经堆闷1~2小时，低温季节可堆闷12小时以上后装袋，从拌料到装袋结束，必须在最短时间内完成，并不允许料袋经受日晒，或者料袋堆码过高，以防培养料在袋内产热变酸。料袋装好后，应立即进行灭菌。在高压灭菌时，进气和放气的速度要慢，即采用慢升压、慢降压的办法，防止因压力骤然变化，引起塑料袋鼓胀变形而造成塑袋的破损。
3、接种：料袋温度必须降至28℃以下接种。
4、发菌：
4.1培养室消毒杀菌：作为菌丝占领料面、分解基料、繁殖扩大的主要生长空间，培养室的清洁卫生以及消毒杀菌状况，将直接对发菌产生不可逆转的影响。生产中一般可在清理卫生的基础上，兑配百病傻溶液对培养室进行地毯式喷洒，隔日重喷，连续2次。夏秋季节发菌时，还应加喷一次敌杀死溶液，密闭门窗，2~3天后，进行通风换气，消除异味，即可将菌袋移入培养。
4.2温度管理：对金针菇这类纯低温型品种而言，发菌期间的关键因素，就是温度的合适与否，如前所述，金针菇菌丝生长的最佳温度为24℃左右，高于或低于该温度，都将在一定程度上对其菌丝生长产生负面影响。但在实际商品生产中，往往因自然温度的过高或过低，而使实际培养过程中很难均衡地保持该温度水平，并且，即使考虑菌丝的健壮和菌袋的污染问题，在有控温设施设备的条件下，也应将发菌的起始温度降至20℃左右，经约7天左右，再逐渐提高，但最好不超过32℃，否则会影响菌丝的正常生长。
4.3湿度管理：金针菇发菌阶段适宜的空气湿度为65%~70%，实际生产中，我们发现，一定范围内，随着空气湿度的降低，发菌的成功率相应提高；当湿度高达80%以上，甚至达到90%以上时，菌袋的污染率上升甚至上升的幅度较大，并且菌丝呈稀疏、纤细的弱势状，而且发菌时间大大延长。但是，任何事物都是一分为二的，研究发现，相同栽培条件下，进行出菇比较时，后者比前者的生物学效率提高15%左右；根据分析，我们认为，该结果可能与发菌期间菌袋的失水和菌袋两头出菇面的含水有关。一般情况下，生产中可将空气湿度调控在70%左右，尽量不使超过80%，这主要是从尽量减少污染、防止病害的角度来考虑的。
4.4通气管理：发菌期间，菌丝需氧量较少，一般保持正常温度条件下，无须特殊的通气措施，但在低温季节发菌时，往往只注重保温，而忽视了培养室内废气的排出，致使室内二氧化碳浓度过高，从而影响菌丝的正常、健壮、快速的生长发育。一般情况下，使室内二氧化碳浓度维持在0.1%左右即可。
4.5光照管理：与其它品种的食用菌相同，金针菇发菌期间同样不需要光照，因此，应予密闭光线，使之黑暗发菌。
5、后熟管理：完成基本发菌后，继续保持不动，令其继续营养生长，以达到菌丝后熟的目的。