我国农业生产中主要依靠化肥促使作物增产，造成土壤有机质含量下降，土壤理化性质变劣，土壤肥力下降；作物秸秆还田可以培肥土壤。传统的观点认为，非腐解态的有机质不宜直接施入土壤。但近年来的大量研究证明，土壤的生物活性是评价土壤肥力的综合指标，而非腐解态的有机物比腐解态的对土壤生物活性有明显优势。
1、增加土壤有机质和养分含量
经研究表明玉米秸秆还田2年后，土壤有机质含量比对照增加0.181%。
2、改善土壤物理性状
秸秆还田后经过微生物的作用形成的腐植酸与土壤中的钙、镁粘结成腐殖酸钙和腐殖酸镁，使土壤形成大量的水稳性团粒结构。
3、提高土壤的生物活性
玉米秸秆含有大量的化学能，是土壤微生物生命活动的能源。秸秆还田可以增强各种微生物的活性，即加强呼吸、纤维分解、硝化和反硝化作用。