芹菜的生理性病害有烧心、空心、叶柄开裂和缺硼症。生理性病害严重影响芹菜的生长，降低产量及品质。其防治方法如下：
首先要避免高温干旱，进行适温适湿管理；对酸性土壤可施用生石灰调节到中性或接近中性；施氮、钾、镁等肥料要适量。一旦发生烧心症状，可用0.5%的氟化钙或硝酸钙溶液向叶面喷雾。
其次应避免在沙性过大的土壤上栽培。除施足底肥外，在生长发育过程中要及时追肥，如发现叶片颜色转浓出现脱肥现象时，可用0.1%的尿素液肥进行根外追肥。
