1.选抗病品种。
2.实行无病毒种子栽培。播种前用清水浸种3～4小时，再放入10%磷酸三钠溶液中浸40～50分钟，捞出后用清水冲净后再催芽播种。定植地要选用未种过西红柿或未发生西红柿病毒病的田块，一定要进行深耕。
3.实行轮作换茬。避免多年连作，减轻病毒病的发生；育苗地彻底清除带毒杂草、病株，减少病毒病的毒源；推广配方施肥技术。
4.栽培防病措施。一是适期播种，培育壮苗；但又不老化；二是适时早定植，促进壮苗早发；三是中耕锄草。
5.早期防蚜虫、粉虱。杜绝蚜虫、粉虱等昆虫媒介传播，可有效地预防病毒侵染，减轻西红柿病毒病的发生。
6.药剂防治。用1.5%植病灵800倍液或20%的病毒A600倍液于幼苗期喷2次，花后每10天喷1次，连喷3～4次。