1.选用抗病品种。
2.实行轮作。番茄与不感病的作物实行三年轮作，是防止土壤传毒的有效途径。
3.种籽处理。播种前种籽用清水浸包3～4小时，再在10%磷酸三钠水溶液中浸种20分钟，捞出后用清水冲洗干净，催芽播种，可消灭粘附在种子表面的烟草花叶病毒（TMV）。
4.改进栽培管理措施。提早深耕，施足底肥，适时播种，培育壮苗，带药栽植，促进根系发育，及早发苗，使生育期提前，到高温干旱适于病害流行的时期，植株已基本通过最易感病的生育阶段，而进入比较抗病的成龄期，从而降低发病率。定植后至果实膨大前，适时中耕培垄，壮大根群，合理灌溉，及时追施磷、钾肥，适时整枝，并在操作过程中及时施用黄豆粉和皂角粉水溶液，喷洒50倍NS—83耐病毒病诱导剂，钝化病毒传染以及提早采收、腾地等，都是防治番茄病毒病的有效措施。
5.药剂防治用90%杜邦万灵水溶性粉剂3000倍液或10%吡虫啉可湿性粉剂3000倍液防蚜虫、并加1.5%植病灵乳剂800～1200倍液，于苗期、定植前和开花初期共喷3次，每隔10～15天一次，对番茄花叶病毒、条斑病毒以及蕨叶均有明显防治效果。
6.用20%“病毒A”500倍液，连喷3次，每7天一次，防治效果达87.5%，对病毒病发病植株有明显的治愈作用。