病毒病是蔬菜的一大类病害，可以由种子、汁液、虫子等传播。病毒病一旦发生往往防治很困难，所以科技界提倡用苗防治病毒病。培养苗首先是选用培养筛除了病毒的植株或材料，速长法加高温处理是常见的方法。其次是利用组织培养获得大量苗木。苗因蔬菜体内无病毒，因此生长势特别好，产量特别高，品质也好。应该指出的是苗子不可能永远。随着栽培时间的延长，自然界的蚜虫、叶蝉、粉虱等传毒害虫会再把病毒传到苗上。不能把种苗的根茎等无限期繁殖利用下去，因为病毒会在苗或材料栽培过程中传播，成为有毒苗。苗要定期更换，已经使用过几年的苗如的瓜、山药等都需要更换新一批苗。
在栽培中我们提倡消毒。多是指某一阶段，采用了消毒的某一种方式，并不是一定要达到完全消灭的水平，只是对病原物进行了杀灭。杀灭是相对的，多不能达到“完全”杀灭的水平。往往是保持在一个较短时间内，使病原物数量呈较少的状态。
常见的真正消毒是医疗单位采用的方式。在食品生产过程中，也常对于培养基或培养原料进行。方式是用高温高压，达到一定时间就能达到消毒的水平。
虽然蔬菜生产中的消毒没有医疗单位那么彻底，但其是很重要的环节。菜农应该注意抓好种子的温水浸种，苗木的药剂喷洒，棚室的高温闷棚等工作，为蔬菜提供一个好的生长环境打下病虫害防治的基础。