玉米粗缩病具有毁灭性，一旦发生了就很难治愈，在病株上喷上某种药剂就使它恢复正常是不现实的，但只要做到农业防治和化学防治相结合，环环紧扣，就一定能够控制其危害蔓延。玉米粗缩病毒主要由灰飞虱以持久性方式传播。麦收之时，则主要迁入玉米田及禾本科杂草上为害并越夏。此时正是夏玉米感病的敏感期，往往造成玉米粗缩病大发生，而对玉米造成严重危害的是第1代灰飞虱。玉米收获后，则迁移至禾本科杂草上，等秋季小麦出苗后，转迁麦田并传毒为害和越冬，形成全年病害循环。玉米粗缩病病株严重矮化，仅为健株高的l/2—1/3，出苗后即可发病。玉米粗缩病的发生完全是由带毒的灰飞虱的传染所至，所以消灭或避开灰飞虱的传播侵染是预防玉米粗缩病发生的重要途径，因此，可通过以下措施进行预防。
一、清除田间杂草。玉米粗缩病病毒主要在小麦、禾本科杂草和灰飞虱体内越冬。因此，要做好小麦丛矮病防治，清除田边、地边和沟渠杂草为害，同时要减少灰飞虱虫口基数，具体方法：在小麦返青后，用25%扑虱灵50克/亩，50%久效磷5000倍液喷雾。喷药时，麦田周围的杂草上也要进行喷施，可显著降低虫口密度，必要时，可用20%克无踪水剂或45%农达水剂550毫升/亩，对水30公斤，针对田边地头进行喷雾，杀死田边杂草，破坏灰飞虱的生存环境。
二、防治麦田灰飞虱，减少传毒媒介。麦田冬灌，消灭灰飞虱越冬若虫用杜邦巨星等除草剂防除麦田杂草，早春小麦拔节期结合治小麦要病喷药防治越冬成虫；小麦抽穗后，结合防病治虫，防治一代灰飞虱。
三、调整玉米播期。为避开灰飞虱迁飞高峰并利于化学防治，夏播玉米应集中在5月底6月上旬为宜，套种距麦收前7天左右，扬好麦后抢茬直播或毁茬播种；春玉米应提前到4月上旬播种，避开越冬成虫发生高峰期。
四、玉米田间管理。(1)用甲拌磷、呋喃丹种衣剂拌种；或用甲拌磷按种子量的0.2%～0.3%拌种；或者用3%呋喃丹颗粒剂随穴撒施，每667m2用量1.5～2kg，对灰飞虱药效可持续30天以上。(2)玉米播种前后及苗期，对玉米田及附近杂草喷杀虫剂防治灰飞虱。常用药剂有：80%敌敌畏乳油、40%氧化乐果乳油、40%久效磷乳油、50%辛硫磷乳油、50%甲胺磷乳油；专用药剂：2%稻虱净(扑虱灵)可湿性粉剂、50%巴沙乳油。病毒A，植病灵(3)苗期发病，应及时拔除病株，带出田外集中烧毁，适当推迟定苗时间，并在玉米3叶期前用1.5%植病灵800～1000倍，20%病毒A500倍喷雾，可有效减轻病害发生。(4)增施有机肥；N，P，K，微肥合理搭配施用；及时中耕松土；当玉米长到5-6叶时及时喷施叶面宝，喷施宝，植物动力等等，促使玉米健壮生长，提高植物自身的抗病能力和感病后的耐病力，控制因粗缩病的发生给田间造成的危害。