魔芋经济价值较高，收挖时间不当，贮藏条件不当会带来一定的经济损失，由于收挖的鲜魔芋含水分高，对贮藏条件要求严格，尤其是种子更是重中之重，所以掌握正确的贮藏方法显得及其重要。
一、收挖
魔芋的收挖期一般在地上部植株倒苗后1个月内，收挖过早，会导致产量降低和不耐贮藏。收挖过晚，由于地上植株已腐烂，标记不明显，收挖时易挖伤球茎，从而导致机械损伤，使魔芋染病腐烂。同时由于进入初冬，霜冻出现，易造成冻伤。一旦确定了魔芋的收挖期后，就应及时选择土壤干爽的晴天进行收挖。收挖时要做到轻挖、轻放、轻搬、轻运，不要损伤表皮，商品芋和种芋要分放，便于收后分类贮藏。特别应注意的是，收挖的种芋还需保护好顶芽，来年种芋才会正常出苗生长。
二、贮藏
魔芋由于怕冻害，采挖期又正值临近初冬，除部分商品芋加工外，需贮藏保鲜的商品芋和种芋要搞好贮藏防冻工作。在贮藏时，商品芋和种芋要分别贮藏，严格剔除破伤、病害、虫害的球茎，被剔除的球茎可随即加工。对于种芋，还应根据本品种的特征进行选择，一般应选择皮色嫩黄、表面光滑、球茎上端口平、窝眼小，整个球茎为碓窝或芋头状，形状整齐、鳞芽肥壮粗短、无病疤、无虫害、无机械损伤，重量在250-500克的球茎为宜，小于250克的球茎，鞭芋可作繁殖种芋用。贮藏可采用以下方法：
1、就地贮藏法。所谓就地贮藏，也就是采挖季节不起挖，加工或出售商品芋时，边起挖边加工出售。这样能节省时间，贮藏保鲜效果好。其方法是：在魔芋自然倒苗后，大地未出现霜冻之前，先在植株干枯的洞眼处，插上木棒或竹签做标记，便于起挖，然后用作物秸秆、树叶等物覆盖于地面，起到防寒保湿的作用，覆盖物要尽量厚些，不得薄于15厘米。同时，在园中要开好围沟和厢沟，做到沟沟相通，并经常清沟排渍，以免园中渍水造成球茎腐烂。
2、土坑贮藏法。选择背风向阳、土壤干燥的地方挖好坑，坑深在1．2米左右，长、宽以贮藏球茎多少而定。放魔芋时，先在土地坑底层和四周铺放5-10厘米厚的干稻草或麦秸，然后将魔芋放人，其堆放厚度以4-5层为宜，堆放好后在魔芋上面再放5厘米厚的稻草，稻草上面覆盖15-20厘米厚的土层。为防止外面的水流进坑内，要在坑四周开好围沟。
3、地窖贮藏法。选择地下水位低、排水良好、土质结实的地方挖窖。窖的大小以能装800-1000公斤魔芋为宜。地窖挖好后，先用稻草或艾叶加硫磺50克将地窖烧一遍，燃烧后封闭2-3天，再打开窖门，等几天后再放魔芋。每窖装魔芋不能过满，以地窖容量的60％-70％为宜。魔芋放窖后，要经常调节好窖内温湿度和通气。人窖初期要打开窖门通风换气，严冬季节要紧闭窖门，但窖门上方要留一个窗口便于通风。