小麦秆黑粉病属于真菌、条黑粉菌属，仅危害小麦、主要危害小麦的茎、叶、穗。是小麦生产上毁灭性病害之一，发病轻者10～20%，重者50～80%，甚至绝收。90年代，河南省发生面积达700余万亩，其中洛阳、周口、三门峡大面积发生，造成小麦产量损失严重。近几年，由于国审强筋小麦品种新麦26大面积推广，小麦秆黑粉病发生呈上升趋势，2013年河南各地均有不同程度发生，没有防治的地块减产严重，给农业生产造成不必要的损失，所以加强小麦秆黑粉病防治，已刻不容缓。
一、传播途径及危害症状
小麦秆黑粉病病菌的越冬方法是，通常情况下是随患病的植物残体在土壤、粪肥中进行越冬。还有的可以随着小麦的种子进行较长距离的传播。这种病菌可以对小麦的嫩芽进行侵染，其达到固定的生长点，就会在小麦的整个生长过程中侵害小麦的整个植株。这种病菌可以侵害小麦的茎、叶和穗等，致使被病菌感染的植株出现分蘖增多的现象。小麦被病菌感染的最初阶段，会出现与叶脉平行的条纹状孢子堆，出现的部位是在茎、叶、叶鞘等部位。出现孢子堆的地方会微微的隆起，而且叶片不舒展。这种症状表现得明显的时期是小麦拔节至孕穗期。表现出的症状是植株矮化和严重扭曲，这时隆起的部分也逐渐变黑、破裂，然后就会有黑色的包子散发出去。大部分患病的植株的麦穗只是在叶鞘内卷缩而不能抽穗。还有的抽出的麦穗是畸形穗并提前死亡。
二、防治措施
小麦秆黑粉病具有两个与防治技术相关的特点：一是病菌孢子可以再极其恶劣的环境下存活。针对这种情况可以进行小麦和玉米、豆类的轮作，特别是重病田块。二是病菌只可以对小麦的嫩芽进行侵染。而且是局部侵染，还有时间的限制。
1.选用抗病、耐病品种
如AK58、周麦22、豫麦49-198、西农979、郑麦366、师栾02-1，这些品种能有效抵抗小麦秆黑粉病的危害。
2.栽培管理措施合理
播种要适期，播种深度要适宜，避免过深，以利出苗。同时注意防治地下害虫。
3.药剂防治
3.1土壤传病为主的地区播种前用50%福美双拌种300克，拌100千克种子。
3.2播种前12.5%烯唑醇（禾果利）可湿性粉剂50克，加水10千克，拌100千克麦种，拌匀后堆闷10小时播种。或选用种子重量0.15%有效成分的20%三唑酮等内吸杀菌剂拌种。
3.3近年实验证明每100公斤小麦拌2%立克秀（戊唑醇）湿拌剂200克或2.5%适乐时（咯菌清）悬浮种衣剂200毫升能够获得更好的防治效果。