番茄茎腐病是土传的真菌性病害。一旦发生，比较难治。重点在防。
苗期发病，可在茎基部施用药土:每平方米表土，施40%拌种双可湿性粉剂9克，充分混匀后，把病部埋上，促其在病斑上方长出不定根。发病初期可用根茎保与克菌康500倍液涂抹患部，70%百菌清可湿性剂600倍液灌根也行。
