红薯常见病害主要有红薯黑斑病、红薯茎线虫病及红薯根腐病。红薯病害防治按照“预防为主，综合防治”的方针，坚持以“农业防治、物理防治、生物防治为主，化学防治为辅”的无公害化治理原则。具体做法如下。
红薯黑斑病
甘薯黑斑病又名黑疤病，症状：该病主要危害薯苗和薯块。薯苗受害，一般在幼苗茎基部，尤其在白部分产生长椭圆形稍凹陷的黑褐色病斑。
农业防治措施：(1)培育无病壮苗。①用无病床土育苗;②用52℃～54℃温水恒温濅种薯10分钟;③苗床上采苗用高剪苗。(2)建立无病留种田。(3)轮作换茬。(4)采用高温大屋窖贮藏甘薯。(5)严格检疫，防止病害扩展蔓延。药剂防治措施：薯种贮藏及育苗时分别用50%多菌灵300-500倍液或70%甲基托布津50-0600倍液浸种或栽植时浸苗基部10分钟。
红薯茎线虫病
甘薯茎线虫病也叫糠心病、菊花心、糠梆子、空心病等。危害症状：皮色正常或发暗，内部褐白相间成糠心或花瓤。
农业防治措施：清除田间病源、选用抗病品种、轮作倒茬、培育无病种薯种苗、不施无病粪肥、严格检疫制度。药剂防治：育苗时，用50%辛硫磷300～500倍液泼浇苗床;病区大田栽植时，每667平方米用50%辛硫磷500克，兑入1000-1500千克浇苗水中，均匀浇入窝中，随后封严。
红薯根腐病
甘薯根腐病亦称烂根病。危害症状：根尖发黑，向上扩展。苗矮小，节短，叶黄变脆，自下而上脱落，严重的干枯死亡。
采取下列农业防治措施(1)选用抗病良种。(2)培育壮苗，适时早栽。(3)深翻改土，增施净肥。(4)轮作换茬。(5)清洁田园，清除病薯残体。(6)建立无病留种田。