甘薯在入窖和贮藏期间，如果管理不当很容易引发多种病害发生。为此，须弄清甘薯贮藏期各种病害发生的原因，以采取相应措施加以预防。
一、甘薯贮藏期主要病害的发生症状及其发病原因
1.甘薯冻害。甘薯冻害是贮藏期腐烂的主要原因之一。①冻害症状。薯块受冻后，受冻部位水浸状，用于挤压有清水渗出。受冻薯块内部变褐发黑，形成硬心、硬皮，蒸煮不烂，且有异味发苦。冻害造成的腐烂一般从薯堆表层开始。②冻害原因。一是因收获过晚，在窖外受冻，开始症状不明显，入窖后15天左右开始腐烂。二是在贮藏中期和后期，由于窖浅或防寒保暖条件差而发生冻害，薯块受冻后，易被病原菌侵染，造成腐烂。
2.甘薯软腐病。①症状。薯块发病后患病部位软化，呈淡褐色水浸状，破皮后流出黄褐色汁液，带有酒精味，病部表面长出白色棉状菌丝，并生出灰黑色小粒。环境条件适合时，病情扩展迅速，4-5天全薯即可腐烂。②发病原因。高温高湿利于甘薯软腐病的发生，在23-29℃、薯块上有露滴时利于病害发生蔓延。薯块受冻、受伤时，病菌就会乘机侵入，这是加重病害发生的重要因素。
3.干腐病。干腐病是甘薯贮藏期主要病害。①症状。发生于收获初期和整个贮藏期，主要侵染薯块。发病初期，薯皮不规则收缩，皮下组织呈海绵状淡褐色，后期薯皮表面产生圆形或不规则形病斑，黑褐色，稍凹陷，边缘清晰。严重时全窖发病，损失严重。②发病原因。种薯和土壤均可带菌。病菌侵染甘薯幼苗后，带菌薯苗在田间呈潜伏状态，甘薯成熟期病菌通过维管束到达薯块而发病。发病适温为20-28℃，30℃以上不易发病。
4.黑斑病。甘薯贮藏期是黑斑病危害最重、损失最大的时期。①症状。病菌浸染后，薯块上出现膏药状青黑色陷斑，并深入薯肉，味苦。潮湿时斑面初现灰色霉层，后现黑色刺状物，病薯不堪食用。②发病原因。薯块和旧窖中残留物均可带菌，病原菌通过伤口侵入薯块，最适发病温度为25-28℃，高温高湿特别是薯块上有水滴时利于黑斑病的发生蔓延。
二、病害控制
1.适时收获、及时入窖。入窖甘薯一般要在当地旬平均气温14-15℃左右、降霜之前收获为宜，避免薯块受冻，减轻病菌浸染机会。
2.薯窖处理。入窖前将旧窖清扫洁净，或将窖壁刨一层土，上一年发病的旧窖可用抗菌剂401或402或硫磺进行熏蒸，密闭两天后，打开窖口充分通风后再使用。
3.精选薯块。入窖时要精选健薯，剔除病薯、伤薯、冻薯，减少病原菌侵染。在收获、运输、贮藏时，要轻拿轻放，防止薯块损伤。
4.薯块消毒。薯块选好后、用50%甲基硫菌灵可湿性粉剂500-700倍液，或用50%多菌灵可湿性粉剂500倍液，浸蘸薯块l-2次，晾干及时入窖。
5.加强薯窖管理。甘薯入窖后要加强温、湿度及通风管理，以达到安全贮藏的目的。一是入窖初期(入窖15-20天内)。此时由于薯块水分大，呼吸作用强，外界气温比较高，所以要敞开窖口，以通风降湿为主。如果长期不通风，窖内二氧化碳浓度增加，薯块易腐烂。二是贮藏中期(入窖20天至次年的2月)。这是管理的关键期，由于天气寒冷，应以保温为主，为此要封严窖口，必要时在薯堆上加盖麦秸等保温，温度保持在10-14℃，以免温度太高薯块发芽，温度太低发生冻害。湿度在85%-90%，防止湿度太大病害蔓延，湿度太小薯块缺水出现干缩糠心。三是贮藏后期(次年3月份以后)。此时外界气温回升，管理的重点是通风降温，避免温度达到15℃以上。