第一防治重点是在小麦扬花期预防穗腐发生。在始花期喷洒50%多菌灵可湿性粉剂800倍液或60%多菌灵盐酸盐（防霉宝）可湿性粉剂1000倍液、50%甲基硫菌灵可湿性粉剂1000倍液、50%多•霉威可湿性粉剂800～1000倍液、60%甲霉灵可湿性粉剂1000倍液，隔5～7天防治一次即可。也可用机动弥雾机喷药。此外小麦生长的中后期赤霉病、麦蚜、粘虫混发区，667m2用40%毒死蜱30ml或10%抗蚜威10g加40%禾枯灵100g或60%防霉宝70g加磷酸二氢钾150g或尿素、丰产素等，防效优异。
第二在齐穗扬花期用50%多菌灵，或70%甲基托布津可湿性粉剂800－1200倍液喷雾，每亩100千克，可以有效地防止病害流行，一般用药1－2次。用多福合剂（含25%多菌灵、15%福美双）500倍液喷雾，可以兼治散黑穗病。