脐橙园主要的病虫害是溃疡病、疮痂病、炭疽病、黄龙病、柑桔红蜘蛛、锈壁虱、潜叶蛾、桔小实蝇等。防治方法应以健生栽培为基础，创造不利于病虫孳生而有利于天敌繁衍的环境条件，保持果园生态平衡。以农业防治、生物防治和物理防治为主，化学防治为辅的综合防治措施。
一、溃疡病
冬季清园，剪除病枝病叶集中烧毁;生长季节见到病叶病枝及时剪除烧毁;注意防治潜叶蛾等害虫，减少伤口;喷药防治：春季开花前及谢花后各喷1次药，夏秋梢在新梢抽出3厘米、展叶期及自剪前各喷1次药。台风雨后及时喷药，防止病菌从伤口侵入。药剂可用33.5%喹啉铜悬浮剂1500～2000倍液或47%春雷•王铜可湿性粉剂800～1000倍液或77%氢氧化铜可湿性粉剂400～600倍液或72%农用硫酸链霉素可溶性粉剂2150～4500倍液。注意喷药时间应在近傍晚进行。
二、疮痂病、炭疽病
加强栽培管理,增施有机肥和钾肥，做好冬季清园工作，剪除的病枝、落叶集中烧毁，并喷波美1°石硫合剂封园。
在春芽长0.2厘米时和花落2/3时喷0.5～0.6%石灰倍量式波尔多液或大生M-45可湿性粉剂800～1000倍液；幼果期和秋梢抽生期喷炭特灵800倍液或25%咪鲜胺乳油800倍液或70%托布津可湿性粉剂800倍液或10%苯醚甲环唑水分散粒剂1200～1500倍液或其他内吸性杀菌剂防治。
三、潜叶蛾
抹除零星夏、秋梢，统一放梢。当新梢长至1粒米长时喷药防治，间隔一星期再喷1次，连续喷2～3次，药剂可用“312”1000～1500倍液加20%杀灭菊酯1500～2000倍液或25%杀虫双800倍液或10％烟碱500～800倍液或40％毒死蜱乳油1000～1500倍液。
四、介壳虫
冬季彻底清园，剪除发生严重的虫枝集中烧毁；春梢萌发前喷45%松脂酸钠可溶粉剂80～100倍液或95％机油乳剂60～100倍液；5月上中旬选用40％杀扑磷1500倍液加95％机油乳剂250倍液或速扑杀800～1000倍液；发生严重的果园隔15天左右再喷1次；8～9月，交替喷25％噻嗪酮1000倍稀释液或40％毒死蜱800～1200倍稀释液l～2次。