水稻机插秧水层管理应坚持薄水移栽，机插结束后，要及时灌水护苗（阴雨天除外），水深以不淹没秧心为宜。
插后3～4天进入薄水层管理，切忌长时间深水，造成根系、秧心缺氧，形成水僵苗。活棵后即进入分蘖期，实行浅水勤灌，灌水时以水深达3厘米左右为宜，待自然落干后再上水，如此反复。达到以水调肥、以水调气、以气促根、水气协调的目的，促分蘖早生快发，植株嫩壮，根系发达。对一些秸秆还田量大的田块，若田脚较烂，发泡起烘，土壤透气性差，应及时脱水爽田1～2天，促进新根生长，然后实行浅灌。
