长时间空负荷怠速运转会导致柴油机热负荷过低，进而增加机油稀释的风险。在怠速运转期间，柴油机的工作温度相对较低，这会导致柴油未能完全燃烧，进入机油系统，稀释机油。这会增加机油的粘度，使其降低润滑性能，加速零部件磨损，缩短柴油机的使用寿命。
长时间空负荷怠速运转会导致燃烧不完全，产生大量的有害废气排放。在柴油机怠速运转时，燃油燃烧不完全会引起一系列有害物质的生成，其中包括一氧化碳、氮氧化物、颗粒物等。这些有害废气的排放对环境和人体健康产生负面影响，加剧空气污染、引发呼吸系统疾病等问题。
另外，长时间空负荷怠速运转还会造成柴油机燃油经济性下降。怠速运转期间，柴油机的负荷非常低，燃油燃烧效率低下。这意味着相同的能源输入下，柴油机的输出功率会下降，从而导致燃油消耗增加。这不仅对企业的生产成本造成影响，也加剧了能源资源的浪费。
长时间空负荷怠速运转还会对柴油机的运行稳定性产生负面影响。怠速运转状态下，柴油机的运行参数会发生变化，如冷却液温度、润滑油温度等。这些参数的变化会影响柴油机的工作性能和稳定性，甚至引发故障。长时间怠速运转还可能导致柴油机的部分零部件长期处于低负荷状态，影响其正常工作和寿命。