驾驶员的操作不当也是拖拉机产生脱档、窜档和乱档的常见原因之一。驾驶员可能会误操作离合器或换挡杆，导致传动系统不正常工作。此外，驾驶员在换挡时没有准确地掌握转速和车速的匹配关系，也会导致传动系统异常。
拖拉机作业环境的不良条件也可能引起传动系统故障。例如，道路崎岖不平或泥泞湿滑的路面会增加传动系统受力，从而增加脱档和窜档的风险。同样，长时间的重负荷工作和高温环境也会使传动系统易于故障。
拖拉机的维护保养不到位也是产生脱档、窜档和乱档的原因之一。定期更换润滑油和保持传动系统清洁是有效预防故障的措施。然而，如果维护保养不及时或不规范，传动系统的磨损和污染将增加，进而增加故障发生的概率。