保养背负式机动喷雾喷粉机的关键是保持清洁。使用后，应立即清洁机器的外部和内部部件。外部部件可以用清水擦拭，确保清除残留的农药或粉末。内部部件需要拆卸并清洗，特别是喷嘴和过滤器。喷嘴可能会堵塞，影响喷粉效果，因此定期检查和清洗是必要的。过滤器可以用洗涤剂清洗，确保通畅。需要保养机动喷雾喷粉机的动力系统。这包括发动机和燃油系统的保养。定期更换机油和空气滤清器，确保发动机正常运行。燃油系统需要定期清洗和检查，以免发生堵塞或腐蚀。
背负式机动喷雾喷粉机在长期保存时，要将机器存放在干燥通风的地方，远离阳光直射和潮湿环境。应定期进行保养，包括清洁和润滑。对于机器的易损件，如喷嘴和过滤器，应储备备用件，以便在需要时更换。