病害发生与温湿度关系密切。病菌生长温度为5-35℃，土温24-30℃为病菌萌发和生长适宜温度。该病为土传病害，发病程度取决于土壤中可侵染菌量。一般连茬种植，地下害虫多，管理粗放，或土壤黏重、潮湿等病害发生严重。病菌从根顶端附近的细胞间隙侵入，边增殖边到达中心柱产生毒素，堵塞导管，破坏根组织，阻碍水分通过。连续降雨后，天气晴朗，气温迅速上升时，发病迅速。高温高湿、温度在8℃～34℃时发病多。病后遇旱或时雨时晴的气候条件下发病多。另外，微酸性土壤、偏施氮肥、土壤黏重以及排水不良等均会导致或加重枯萎病的发生。