病源菌在土壤,病残体和带菌种子中越冬,成为下一季玉米发病的初侵染菌源。种子带菌还可远距离传播,使发病区域不断扩大。顶腐病具有某些系统侵染的特征,病株产生的病源菌分生孢子还可以随风雨传播,进行再侵染。在低洼地块、土壤粘重地块相对发病严重;水田改旱田地块,坡地和高岗地发病轻。