病部表面通常密生棉絮状白霉。受害果实变黄褐色，病部长出毛绒状白霉，可与疫病、炭疽病相区别。南瓜绵腐病主要侵染南瓜果实，侵染后，果实表面会出现水渍，随后扩展为黄色或褐色的水渍，果实腐烂、潮湿的环境中，还会长出浓密的白色絮丝。由真菌瓜果腐霉引起的南瓜绵腐病，在三叶期以前染病症状同猝倒病。果实染病时，初现水渍状斑点，扩展后为黄色或褐色水渍状大病斑，与健部分界明显，后半个或整个果实腐烂，并在外部长出一层茂密的白色絮状菌丝体，一般果实多从脐部或伤口感染。
