防治方法包括：(1)选用抗病品种。(2)选用无病种子并进行种子处理，用0.3%的50%福美双或40%大富丹拌种。(3)大豆收获后及时进行秋耕，加速病残体腐烂，减少初侵染源。(4)在开花始期、蕾期、结荚期、嫩荚期各喷1次30%碱式硫酸铜(绿得保)悬浮剂400倍液或1：1：160倍式波尔多液、50%苯菌灵可湿性粉剂1500倍液、36%甲基硫菌灵悬浮剂500倍液，每667平方米喷对好的药液55L左右。紫斑病防治方法包括：(1)合理轮作。(2)清除田间残枝病叶。(3)利用杀真菌药剂处理种子，例如用拌种双、多菌灵或福美双的种衣剂拌种。(4)在开花结荚初期可喷洒多菌灵、甲基托布津等杀菌剂。