芹菜菌核病在芹菜全生育期均可发病。主要危害靠近地面的叶片叶柄基部、茎，受害部位初期呈水渍状褐色病斑，在潮湿的条件下呈软腐状，表面产生白色棉絮状菌丝体，后产生黑色鼠粪状菌核，发病严重时叶片枯死。
芹菜菌核病为害芹菜茎、叶。病害常先在叶部发生，发病初叶片形成暗绿色病斑，潮湿时表面生白色菌丝层，后向下蔓延，引起叶柄及茎发病。病处初为褐色水渍状，后形成软腐或全株溃烂，表面生浓密的白霉，最后形成鼠类状菌核。
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